Сделать с помощью заливки нужный градиент, где белый - 100% прозрачно, черный - не прозрачно и скопировать его в предварительно созданный альфаканал для верхнего из слоев.
Или проще - взять кисть "ластик", сделать его огромным (размер - под 500), сделать края кисти ластка размытыми - и ручками стереть часть верхнего слоя...